Uno degli obiettivi dell'agricoltura biologica è di mantenere il bestiame sano in linea di principio, principalmente adottando misure preventive. La salute del bestiame dipende da una serie di fattori come l'ambiente, l'alimentazione, l'alloggio, il comportamento sociale all'interno della mandria o del gregge, nonché la gestione generale e l'allevamento. Le strategie olistiche di salute degli animali tengono conto di tutti questi fattori; insieme, sono alla base della gestione preventiva della salute della mandria / gregge.

Quando gli animali da produzione alimentare si ammalano, vengono in gran parte trattati con medicinali veterinari ortodossi, come gli antibiotici. Tuttavia, l'uso frequente di antibiotici porta allo sviluppo di microrganismi resistenti agli antibiotici e questi si trovano spesso negli animali da allevamento. Inoltre, attraverso le feci e le urine degli animali tali microrganismi resistenti agli antibiotici vengono scaricati nell'ambiente dove possono degradarsi solo lentamente.

Nell'agricoltura biologica, la preferenza deve essere data al trattamento degli animali malati mediante pratiche veterinarie complementari (ad esempio fitoterapia o omeopatia). I farmaci veterinari sintetizzati chimicamente devono essere ridotti al minimo e dovrebbero essere utilizzati solo in caso di emergenza.

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